XII. Piusz már 1942-ben tudhatott a holokausztról: egy nemrégiben feltár dokumentum szerint az 1939-től majd húsz éven át szolgált egyházfő pontos információkkal rendelkezhetett a második világháború alatt az európai zsidóság szisztematikus megsemmisítéséről a haláltáborokban.
A pápával kapcsolatban rendre visszatér a kérdés, hogy vajon minden tőle telhetőt megtett-e a zsidók védelmében. A vádat, hogy rideg számításból hallgatott a holocaustról, csak az egyházat akarta védeni és nem akarta gyengíteni a kommunizmus elleni harcot, elsőként Rolf Hochhuth német szerző hatvanas években bemutatott A helytartó című darabjában fogalmazta meg.
A most előkerült dokumentum egy német jezsuita által írt és a pápa személyi titkárának címzett levél, amely részletes információkat tartalmaz a zsidók tömeges elgázosításáról a nácik által megszállt Lengyelországban.